ヘムタンパク質の科学
・多種多様な生理機能をそなえ今も生命研究の最前線に立ち続ける「ヘムタンパク質」研究の大著発刊!
・歴史的な成果を顧みつつ体系的・網羅的に領域を俯瞰! 初学者からトップ研究者まで必携。
・錯体化学、生物無機化学、構造生物学、物理科学、植物科学や応用・展開研究なども視野に構成。
城 宜嗣(兵庫県立大学 生命理学研究科 )、青野 重利(自然科学研究機構生命創成探究センター)、齋藤 正男(東北大学 多元物質科学研究所 名誉教授)
27,500 円(本体25,000円+消費税、送料込)
執筆者
監修
城 宜嗣 兵庫県立大学 大学院理学研究科 教授
青野 重利 自然科学研究機構生命創成探究センター 教授
齋藤 正男 東北大学名誉教授
執筆者(執筆順)
北川 禎三 兵庫県立大学 客員研究員/
自然科学研究機構分子科学研究所名誉教授
島田 敦広 岐阜大学 応用生物科学部 准教授
吉川 信也 兵庫県立大学 大学院理学研究科 特任教授
當舎 武彦 国立研究開発法人理化学研究所 放射光科学研究センター 専任研究員
城 宜嗣 兵庫県立大学 大学院理学研究科 教授
増田 建 東京大学 大学院総合文化研究科 教授
五十嵐 城太郎 福島県立医科大学 医学部 准教授
松岡 有樹 福島県立医科大学 医学部 教授
藤山 敬介 国立研究開発法人理化学研究所 環境資源科学研究センター 訪問研究員
永野 真吾 鳥取大学 大学院工学研究科 教授
日野 智也 鳥取大学 大学院工学研究科 准教授
清水 透 東北大学名誉教授
柳澤 幸子 兵庫県立大学 大学院理学研究科 准教授
藤井 浩 奈良女子大学 研究院自然科学系化学領域 教授
村木 則文 自然科学研究機構生命創成探究センター/分子科学研究所 助教
青野 重利 自然科学研究機構生命創成探究センター 教授
牧野 龍 立教大学名誉教授
澤井 仁美 兵庫県立大学 大学院理学研究科 助教/
(現)長崎大学 大学院工学研究科 准教授
石森 浩一郎 北海道大学 大学院理学研究院 教授
若杉 桂輔 東京大学 大学院総合文化研究科 教授
杉本 宏 国立研究開発法人理化学研究所 放射光科学研究センター 専任研究員
松井 敏高 東北大学 多元物質科学研究所 准教授
齋藤 正男 東北大学名誉教授
内田 毅 北海道大学 大学院理学研究院 准教授
久保 稔 兵庫県立大学 大学院理学研究科 教授
堀谷 正樹 佐賀大学 農学部 准教授
堀 洋 (元)大阪大学 大学院基礎工学研究科 准教授
木村 哲就 神戸大学 大学院理学研究科 准教授
加藤 優 北海道大学 大学院地球環境科学研究院/大学院環境科学院 准教授
八木 一三 北海道大学 大学院地球環境科学研究院/大学院環境科学院 教授
重田 育照 筑波大学 計算科学研究センター 教授
下山 絋充 筑波大学 計算科学研究センター 研究員
神谷 克政 神奈川工科大学 基礎・教養教育センター 准教授
鷹野 優 広島市立大学 情報科学研究科 教授
末松 誠 慶應義塾大学 医学部 教授
加部 泰明 慶應義塾大学 医学部 准教授
中木戸 誠 東京大学 大学院工学系研究科 講師
津本 浩平 東京大学 大学院工学系研究科 教授
松原 三佐子 大阪市立大学 大学院医学研究科 特任講師/
(現)大阪公立大学 大学院獣医学研究科 准教授
河田 則文 大阪市立大学 大学院医学研究科 教授/
(現)大阪公立大学 大学院医学研究科 教授
松井(渡部)美紀 東北大学 大学院医学系研究科 助教
五十嵐 和彦 東北大学 大学院医学系研究科 教授
村山 和隆 東北大学 大学院医工学研究科 准教授
榊 利之 富山県立大学名誉教授
安田 佳織 富山県立大学 工学部 講師
向井 邦晃 慶應義塾大学 医学部 専任講師
原田 信広 藤田医科大学名誉教授
林 孝典 藤田医科大学 医学部 講師
青山 由利 創価大学名誉教授
山崎 浩史 昭和薬科大学 薬学部 教授
新谷 泰範 国立研究開発法人国立循環器病研究センター研究所 分子薬理部 部長
西田 優也 国立研究開発法人国立循環器病研究センター研究所 分子薬理部 上席研究員
北 潔 長崎大学 大学院熱帯医学・グローバルヘルス研究科 研究科長/教授/
東京大学名誉教授
轟 泰司 静岡大学 農学部 教授
伊藤 晋作 東京農業大学 生命科学部 准教授
浅見 忠男 東京大学 大学院農学生命科学研究科 教授
田中 良和 サントリーグローバルイノベーションセンター株式会社 研究部 上席研究員
福留 光挙 香川大学 農学部 助教
内海 俊樹 鹿児島大学 大学院理工学研究科 教授
渡辺 芳人 自然科学研究機構分子科学研究所 所長
荘司 長三 名古屋大学 大学院理学研究科 教授
大洞 光司 大阪大学 大学院工学研究科 准教授
林 高史 大阪大学 大学院工学研究科 教授
北岸 宏亮 同志社大学 理工学部 教授
小松 晃之 中央大学 理工学部 教授
目次
序論 ヘムタンパク質の研究の歴史 《北川 禎三》
1. はじめに
2. ヘモグロビン
3. Perutzモデル
4. タンパク四次構造とMWCモデル
5. MWCモデルからTTSモデルへ
6. おわりに
第1編 基礎研究
第1章 エネルギー変換に関与するヘムタンパク質
第1節 シトクロム酸化酵素―この未知なるもの― 《島田 敦広/吉川 信也》
1. はじめに
2. CcOの機能中心の構造
3. O2還元機構
4. プロトンポンプ機構
5. おわりに
第2節 脱窒反応系:ヘムタンパク質によるN-N結合の再生 《當舎 武彦/城 宜嗣》
1. はじめに
2. 脱 窒
3. 可溶性NO還元酵素:P450nor
4. 膜結合型NO還元酵素:NOR
5. 今後の展望
第3節 植物のヘム生合成と代謝 《増田 建》
1. はじめに
2. 植物のヘム代謝系
3. ヘム代謝系酵素の機能と局在性
4. クロロフィルとヘムの合成制御
5. シグナルとしてのヘムの機能
6. 植物に特徴的なヘムタンパク質
7. おわりに
第2章 物質輸送・物質変換に関与するヘムタンパク質
第1節 真核生物に見られる短縮型グロビン・フラボヘモグロビン 《五十嵐 城太郎/松岡 有樹》
1. はじめに
2. 短縮型グロビン
3. フラボヘモグロビン
4. 今後の展望
第2節 一原子酸素添加酵素
第1項 シトクロムP450概説―その発見,興隆と今後の展望― 《藤山 敬介/日野 智也/永野 真吾》
1. シトクロムP450の研究の歴史と多様性
2. P450の命名法
3. P450の構造
4. P450の紫外可視吸収スペクトル
5. P450が触媒する反応と還元系
6. 近年のP450研究の動向
7. P450研究の展望
第2項 生体内での一酸化窒素の産生:NO合成酵素の構造と機能を中心に 《清水 透》
1. 生体内でのNOの産生
2. NO合成酵素
3. NOとセンサータンパク質との反応
4. 総 括
第3節 二原子酸素添加酵素 《柳澤 幸子/城 宜嗣》
1. ヘム含有ニ原子酸素添加酵素
2. 二原子酸素添加酵素の発見
3. 免疫抑制への関わり?1998年以降?
4. 結晶構造?2006年・2007年?
5. 阻害剤の探索
6. 反応機構研究
7. 今後の展望
第4節 酸素添加・酸化酵素の反応機構と反応中間体の電子構造 《藤井 浩》
1. 酸素添加酵素の反応機構―原子酸素添加酵素の反応機構と反応中間体
2. Compound Ⅰを生成する他のヘム酵素 ペルオキシダーゼとカタラーゼの反応機構
3. P450 のCompound Ⅰ
4. Compound Ⅰの電子構造
5. Compound Ⅰのモデル錯体と基質との反応機構
第5節 アルドキシム脱水酵素 《村木 則文/青野 重利》
1. はじめに
2. アルドキシム脱水酵素の構造と機能
3. 今後の展望
第3章 情報変換・情報伝達に関与するヘムタンパク質
第1節 ヘム依存型ガスセンサータンパク質
第1項 酸素センサータンパク質 《青野 重利》
1. はじめに
2. ヘム含有型酸素センサータンパク質の構造と機能
3. おわりに
第2項 COセンサータンパク質 《青野 重利》
1. はじめに
2. バクテリア由来のCOセンサータンパク質
3. 哺乳類に存在するCOセンサータンパク質
4. おわりに
第3項 可溶性グアニル酸シクラーゼとそのホモログタンパク質の構造と機能 《牧野 龍》
1. はじめに
2. 可溶性グアニル酸シクラーゼの構造と機能
3. 細菌由来のH?NOXの構造と機能
4. おわりに
第2節 シグナル分子として機能するヘム
第1項 原核生物のヘムセンサータンパク質 《澤井 仁美》
1. はじめに
2. バクテリアのヘム獲得機構で機能するヘムセンサータンパク質
3. おわりに
第2項 真核生物のヘムセンサータンパク質 《石森 浩一郎》
1. はじめに
2. ヘム制御タンパク質の機能
3. ヘム制御タンパク質におけるヘム結合様式
4. 代表的なヘム制御タンパク質
5. おわりに
第3節 ニューログロビン 《若杉 桂輔》
1. 脳内グロビンタンパク質ニューログロビン研究の歴史・背景
2. Ngb研究の現状
3. Ngb研究の将来展望
第4章 ヘム輸送とヘム代謝
第1節 バクテリアのヘムトランスポーター 《杉本 宏》
1. 病原性バクテリアによるヘムの獲得と輸送
2. グラム陰性菌外膜のヘムの透過
3. ペリプラズム層でのヘム結合タンパク質
4. ヘムABCトランスポーター
5. ヘムトランスポーターの分子メカニズム
6. ヘムトランスポーターの研究の展望
第2節 ヘム分解酵素の多様な分子機構 《松井 敏高/齋藤 正男》
1. はじめに
2. 従来型ヘム分解酵素HO
3. 新たなヘム分解反応
4. 今後の展望
第3節 金属イオンの取り込みに関与するヘム含有酵素 《澤井 仁美》
1. はじめに
2. 金属イオンの取り込み機構
3. 各種ヘム含有Fe3+還元酵素の機能と構造
4. おわりに
第5章 測定解析技術
第1節 振動(共鳴ラマン・赤外・NRVS)分光 《内田 毅/當舎 武彦》
1. はじめに
2. 共鳴ラマン分光法
3. 赤外分光法
4. 核共鳴非弾性散乱法(NRVS)
5. 今後の展望
第2節 反応ダイナミクスの時間分解測定 《久保 稔》
1. はじめに
2. 時間分解分光の測定技術
3. 時間分解X線結晶構造解析の測定技術
4. おわりに
第3節 磁気共鳴EPRでヘムタンパク質の何をみるか?
―活性中心の電子状態とミクロ分子環境― 《堀谷 正樹/堀 洋》
1. はじめに
2. ヘムの電子状態
3. 酸化型ヘムタンパク質の磁化率とEPR測定
4. 還元型ヘムタンパク質の磁化率とEPR測定
5. 高酸化型ヘムタンパク質の磁化率とEPR測定
6. 短寿命反応中間体の捕捉とEPR 測定
第4節 磁気共鳴NMR 《石森 浩一郎》
1. はじめに
2. 常磁性シフト
3. 常磁性NMRを用いた研究例
4. おわりに
第5節 反応速度論 《當舎 武彦/木村 哲就》
1. はじめに
2. 三成分系の速度論解析
3. 複雑な反応系の速度論解析
4. 今後の展望
第6節 ヘムタンパク質の電気化学 《加藤 優/八木 一三》
1. はじめに
2. タンパク質フィルム電気化学
3. ヘム含有電子伝達タンパク質の電気化学
4. ヘム含有酵素の電気化学
5. 今後の展開
第7節 計算化学によるヘムタンパク質の機能解析と予測
《重田 育照/下山 絋充/神谷 克政/鷹野 優》
1. はじめに
2. ヘムに対する応用計算事例
3. 展望(理論計算とデータ科学の融合)
第2編 展開研究
第1章 ヘムタンパク質と医学・薬学
第1節 ヘムタンパク質によるガス分子の受容による細胞機能制御と医学への展開:
PGRMC1-CO系を例として 《末松 誠/加部 泰明》
1. はじめに
2. COの生物作用の発見:NOと異なる役割
3. メタボロミクス技術によるCOの標的分子の系統的探索:CBSの役割
4. COによるタンパク質メチル化修飾の制御:解糖系酵素PFKFB3の役割
5. 脳微小循環の低酸素性拡張反応におけるCO-CBS系と硫化水素(H2S)の役割
6. 新しいCO受容体,PGRMC1の構造機能相関とがんにおける役割
7. おわりに
第2節 病原菌のヘム取り込みシステムと抗菌薬 《中木戸 誠/津本 浩平》
1. 病原性微生物による宿主からのヘム鉄獲得
2. グラム陰性菌のヘム鉄獲得機構:Has システム
3. グラム陽性菌のヘム鉄獲得機構①:黄色ブドウ球菌Isdシステム
4. グラム陽性菌のヘム鉄獲得機構②:化膿レンサ球菌siaシステム
5. 鉄取り込みシステムを標的とした抗菌剤開発
6. 各種モダリティ分子を用いた病原因子の機能阻害に基づく抗菌剤開発
7. 研究の将来展望
第3節 サイトグロビンと肝臓がん 《松原 三佐子/河田 則文》
1. はじめに
2. HSCにおけるCYGB発現の意義
3. おわりに
第4節 転写因子Bach天然変性領域における多重ヘム結合の分子機構
《松井(渡部) 美紀/村山 和隆/五十嵐 和彦》
1. 歴史・背景
2. 研究の現状
3. 将来・展望
第5節 P450と疾病,創薬
第1項 ビタミンD代謝に関わるシトクロムP450 《榊 利之/安田 佳織》
1. はじめに
2. ビタミンD25位水酸化酵素について
3. ビタミンD1α位水酸化酵素CYP27B1について
4. ビタミンD24位水酸化酵素CYP24A1について
5. おわりに
第2項 ステロイド代謝とP450:コルチゾール・アルドステロン合成の構造生物学
《向井 邦晃/杉本 宏/神谷 克政》
1. ステロイドホルモンの合成
2. CYP11B1とCYP11B2に関する機能と構造の研究経過
3. CYP11B1変異体を用いた研究
4. 展 望
第3項 乳がんとアロマターゼ 《原田 信広/林 孝典》
1. 研究の歴史・背景
2. 研究の現状
3. 研究の将来展望
第4項 アゾール系抗真菌薬の標的酵素としてのチトクロムP450 《青山 由利》
1. 研究の背景
2. CYP51解析のスタート
3. CYP51の特徴
4. 近年の解析から将来を見る
第6節 医薬品代謝 《山崎 浩史》
1. 研究の歴史・背景
2. 研究の現状
3. 研究の将来展望
第7節 呼吸鎖酵素に保存されたアロステリック部位を利用した抗菌剤の開発
《新谷 泰範/西田 優也》
1. 背 景
2. 研究内容
3. おわりに
第8節 寄生虫ミトコンドリアのヘムタンパク質:化学療法の標的として 《北 潔》
1. はじめに
2. 回虫成虫ミトコンドリアのNADH-フマル酸還元系
3. マラリア原虫の呼吸鎖電子伝達系
4. おわりに
第2章 ヘムタンパク質と農学
第1節 P450と植物ホルモン
第1項 アブシシン酸代謝不活性化酵素の阻害による乾燥耐性付与 《轟 泰司》
1. 研究の歴史・背景
2. 研究の現状
3. 将来の研究展望
第2項 チトクロームP450阻害剤によるブラシノステロイド・ストリゴラクトン生合成の制御
《伊藤 晋作/浅見 忠男》
1. はじめに
2. ジベレリン
3. ブラシノステロイド
4. ストリゴラクトン
5. サイトカイニン,ジャスモン酸
第2節 P450遺伝子を利用して新しい花色を作る 《田中 良和》
1. はじめに
2. フラボノイド
3. ベタレイン
4. カロテノイド
5. まとめ
第3節 植物ヘモグロビンとその応用展開の可能性 《福留 光挙/内海 俊樹》
1. 植物ヘモグロビンの研究の歴史
2. 植物ヘモグロビンのクラス分類と特徴
3. Phytogbと共生窒素固定
4. Phytogb1の機能と応用
第3章 ヘムタンパク質と工学
第1節 デコイ分子を利用したP450 反応 《渡辺 芳人/荘司 長三》
1. はじめに
2. 過酸化水素を基質酸化に使うヘム酵素
3. デコイ( Decoy)コンセプト
4. デコイ( Decoy)の存在証明
5. P450BM3 とデコイ
6. 第二,第三世代デコイ
7. 合成触媒としてのP450の可能性
第2節 ヘムタンパク質のヘム置換による人工金属酵素の開発 《大洞 光司/林 高史》
1. 研究の歴史・背景
2. 研究の現状
3. 研究の将来展望
第3節 ヘムタンパク質の水溶性モデル錯体の構築と生体内利用 《北岸 宏亮》
1. ミオグロビンのバイオミメティック・ケミストリー
2. 水溶性ヘムタンパク質モデル錯体
3. ヘムタンパク質モデル錯体の生体内利用
4. 将来展望
第4節 ヘモグロビンを用いた人工酸素運搬体(赤血球代替物)の開発 《小松 晃之》
1. はじめに
2. ヘモグロビンの構造と酸素結合
3. 人工酸素運搬体の歴史
4. Hbを用いた人工酸素運搬体の開発動向
5. 人工酸素運搬体の応用展開